（1）该房地产开发企业项目属于税务机关可要求其进行土地增值税清算的情形。
根据规定，已竣工验收的房地产开发项目，已转让的房地产建筑面积占整个项目可售建筑面积的比例在85％以上，或该比例虽未超过85％，但剩余的可售建筑面积已经出租或自用的属于主管税务机关可要求纳税人进行土地增值税清算的情形。本题中虽然已转让的房地产建筑面积占整个项目可售建筑面积的比例虽未超过85％，但剩余的可售建筑面积已经出租。（1分）
（2）该公司计算土地增值税时应扣除的取得土地使用权支付的金额＝（4800＋120）×2/3＝3280（万元）（1分）
（3）该公司计算土地增值税时应扣除的开发成本＝2000＋180＝2180（万元）（0.5分）
（4）该公司计算土地增值税时应扣除的开发费用＝300＋10＋（3280＋2180）×5%＝583（万元）（1分）
（5）该公司扣除项目合计＝3280＋2180＋583+840+（3280+2180）×20%＝7975（万元）
增值额＝15000－7975＝7025（万元）
增值率＝7025÷7975×100%＝88.09%
适用的税率是40%，速算扣除系数是5%
应缴纳的土地增值税＝7025×40%－7975×5%＝2411.25（万元）（1分）
（6）凡属税务机关要求纳税人进行土地增值税进行清算的项目，纳税人应当在接到清算通知之日起90日内，到主管税务机关办理清算手续。（0.5分）
