（1）不可以申请印花税退税。根据规定，凡多贴印花税票者，不得申请退税或者抵用。
（2）①专有技术使用权转移书据属于产权转移数据，适用0.5‰的印花税率，因此技术转让书据应缴纳印花税＝合同金额×适用税率＝60×0.5‰×10000＝300（元）。②同一份合同或凭证，载有两个或两个以上经济事项而适用不同税目税率的，可以同时适用一个或几个税率分别计算贴花。如未分别记载金额的，应按照其中较高的税率计算纳税。因此该合同按照加工承揽合同适用0.5‰的税率。即购销合同、加工承揽合同应缴纳印花税＝100×0.5‰×10000＝500（元）。
（3）公司转让旧厂房（存量房）应缴纳的税种有增值税、城建税及教育费附加、地方教育附加、土地增值税、印花税、企业所得税。
（4）公司转让旧厂房（存量房）涉及的土地增值税扣除项目金额确定有两种情况：
①转让旧房及建筑物能够取得评估价格，此时可以扣除房屋及建筑物的评估价格、取得土地使用权所支付的地价款或出让金、按国家统一规定缴纳的有关费用和转让环节缴纳的税金。其中，旧房及建筑物的评估价格＝重置成本价×成新度折扣率。
②转让旧房及建筑物不能取得评估价格，但能提供购房发票，此时扣除项目金额为：经当地税务部门确认，取得土地使用权支付的金额、旧房及建筑物的评估价格，可按发票所载金额并从购买年度起至转让年度止，每年加计5%计算扣除。此外可扣除与转让房地产有关的税金，其中对纳税人购房时缴纳的契税，能提供契税完税凭证的，准予作为“与转让房地产有关的税金”予以扣除，不作为加计5%的基数。
此外，对于转让旧房及建筑物，既没有评估价格，又不能提供购房发票的，税务机关可以根据规定，实行核定征收。
