（1）应调增应纳税所得额30万元。
说明：外购商誉的支出，不得计算摊销，只能在企业整体转让或清算时，准予扣除。
（2）支付中介服务机构佣金扣除限额=150×5％=7.5（万元）＜实际支付佣金10万元，故应调增应纳税所得额2.5万元。
说明：一般企业发生的手续费及佣金支出，不超过中介服务协议或合同确认收入金额的5％的部分，准予扣除；超过的部分，不得扣除。
（3）①业务（3）应补缴的增值税=5÷（1+13％）×13％=0.58（万元）。业务（3）应补缴的城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加=0.58×（7％+3％+2％）=0.07（万元）。
业务（3）应补缴的增值税、城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加=0.58+0.07=0.65（万元）。
②业务（3）会影响企业会计利润，会计利润减少0．65万元。
说明：向购买方收取的违约金属于价外费用，应并入销售额中计算缴纳增值税。会计上增值税一般纳税人缴纳的增值税不影响当期损益，而该企业将5万元全部计入营业外收入，属于账务处理错误，多确认了会计利润0.58万元，其会计利润应减少0.58万元。补缴的城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加记入“税金及附加”科目，会计利润减少0．07万元。
（4）正确。
理由：该房屋为营改增之前取得的不动产，一般纳税人转让营改增前取得（不含自建）的不动产，可以选择适用简易计税方法计税。
说明：一般纳税人转让其2016年4月30日前取得（不含自建）的不动产，可以选择适用简易计税方法计税，以取得的全部价款和价外费用扣除不动产购置原价或者取得不动产时的作价后的余额为销售额，按照5％的征收率计算应纳税额。
（5）转让旧房在计算土地增值税时可以扣除的项目有：取得土地使用权所支付的金额；与转让房地产有关的税金；旧房及建筑物的评估价格。
（6）①业务（5）应缴纳的增值税=（5500—4000）÷（1+5％）×5％=71．43（万元）。
②土地增值税应税收入=5500—71.43=5428．57（万元），扣除项目合计=6000×60％+12=3612（万元）。
增值额=5428.57—3612=1816.57（万元），增值率=1816.57-3612×100％=50.29％。土地增值税税额=1816.57×40％一3612×5％=546.03（万元）>企业自行缴纳的土地增值税6.43万元。会计利润应减少额=546.03—6.43=539.6（万元）。
说明：缴纳的土地增值税在会计上记入“税金及附加”科目，会影响企业会计利润。土地增值税增值额=应税收入一扣除项目，增值率=增值额。扣除项目金额×100％。
（7）可以。
理由：企业在2018年1月1日至2023年12月31日期间新购进的设备、器具（除房屋、建筑物以外的固定资产），单位价值不超过500万元的，允许一次性计入当期成本费用，在计算应纳税所得额时扣除，不再分年度计算折旧。
（8）会计上当年摊销的金额=90÷3×2÷12=5（万元），税法上选择一次性在应纳税所得额中扣除，应调减应纳税所得额=90—5=85（万元）。
（9）2023年企业所得税应纳税所得额=3800—0.65—539.6+30+2.5—85—90÷2=3162.25（万元）。
说明：铁路债券取得的利息收入，减半征收企业所得税。
（10）2023年应补缴的企业所得税=3162.25×25％一420=370.56（万元）。
（11）④正确。
理由：对纳税人超过应纳税额缴纳的税款，纳税人自结算缴纳税款之日起3年内发现的，可以要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息。本题已经超过退还时限，故不可以申请退还多缴税款。
②不可以。
理由：此行为属于税务机关作出的征税行为，当事人不服税务机关及其工作人员作出的税务具体行政行为的，应当先向行政复议机关申请行政复议，经复议仍不服的，才能向人民法院提起行政诉讼。
